作为北京市9座中心城区污水处理厂之一，肖家河污水处理厂位于中关村科技产业园核心区域，是全国首家由民营企业投资建设的BOT水务项目。水厂建成于2002年，当时的北京市领导曾亲赴项目调研，对项目开创中国水务市场化先河给予过高度评价。
2013年，北京市污水治理三年行动方案正式发布实施，拟加大城区污水处理设施升级改造力度，提倡地下再生水厂建设。肖家河污水处理厂再次承担重任，于当年8月正式开工建设。这也是北京市三年行动计划中最难的一个项目，要求在原址不增地、不停水的情况下提标，且扩建处理能力从2万吨/日到8万吨/日。
经过精心设计和组织施工，历时近三年，肖家河污水处理厂终升级成功，获全面通水，其中主要指标满足地表水IV类水体标准，与清河再生水厂出水指标一致。
据介绍，新肖家河污水处理厂采用了桑德集团开发的脉冲曝气节能膜生物反应器(MBR)，比常规膜生物反应器节能60%以上，是目前国内最节能的膜生物反应器。这个技术也获得了北京市2015年科学技术进步三等奖。
