建所以来，成都生物所承担了重点研发计划、重大科技专项、科技支撑计划、973、863、自然科学基金等一大批国家级科研项目。获得了包括国家科学技术奖等在内的300余项科研成果，为长江上游生态建设和生物多样性保护做出了重要贡献，以“地奥心血康”为代表的众多科技成果成功实现产业化，有力地推动了国家和地方社会经济发展。与众多国际组织以及美、德、英、法、俄罗斯、克罗地亚等20余个国家和地区的大学和科研机构建立了良好的合作关系，与国内众多高校、科研院所、企业建立了紧密的战略伙伴关系。
成都生物所是“中国-克罗地亚生物多样性和生态系统服务‘一带一路’联合实验室”、国家天然药物工程技术研究中心、中国科学院山地生态恢复与生物资源利用重点实验室、生态保育与生物多样性保护四川重点实验室、中国科学院环境与应用微生物重点实验室、环境微生物四川省重点实验室的依托单位。
