南京水科院是我国最早成立水利科学的研究机构，成立于1935年，长期从事水利、水运、水文、岩土、材料结构方面的基础理论和工程应用研究，具有雄厚的科研实力和丰富的研究成果。勘测设计院作为南京水科院科研成果转化和应用的平台，具有独特的科学研究和工程技术优势。设计院重视人才资源的培养，现具备专业全面、级配合理的勘察设计技术力量，硕士及以上学历的技术人员及高级职称及以上技术骨干超过50%，拥有诸如一级建筑师、一级结构工程师、注册土木工程师（岩土、港航、水利）、注册造价工程师等一大批国家注册人员，技术力量雄厚。勘察拥有良好的软、硬件设施，设计用设备、仪器、计算机、正版专业软件等配备齐全。在三十余年的发展中，设计院以工程项目勘察、设计及咨询为主要特色，不断积淀工程技术经验和扩大综合实力，积极与南京水利科学研究院内的研究部门合作，现已形成独具特色的专业方向和勘察设计管理模式，完成包括水利、水运、岩土、海洋、建筑、水文、测量等大、中型项目三千余项，工程项目遍布海内外，积累了大量工程勘察设计技术经验和人才，设计成果获得了建设单位好评，并在体现自身特色的领域赢得了良好声誉。
设计院一贯坚持“规范、科学、求实、准确”的质量方针，恪守信誉、提高声望，弥补不足，努力打造市场品牌，把自身发展成技术领先、服务优秀、管理先进、独具特色的工程技术咨询服务单位，使之成为缔造优秀工程、培养高级人才、转化先进成果的基地。
