公司内设办公室、人力资源部、财务部、纪检审计室、运营管理部、工程管理部、信息技术部、物资管理部、安全管理部等9个部门，下设10家街道分公司、1家生态环境分公司和2家全资子公司（深圳市宝水水利服务有限公司、深圳市宝排水质检测中心有限公司）。现有员工1735人，其中，管理及专业技术人员520人(硕士研究生55人、本科414人)，一线员工1215人(含劳务派遣769人)；高级职称9人，中级职称99人，初级职称148人。
公司现有作业车辆365辆，包括应急抢险车（抽排量达39500方每小时）、管网清疏作业车、日常巡查作业车等三类，其中大型进口联合疏通车4辆、吸污车13辆、多功能抢险车10辆、“龙吸水”14辆；配备CCTV管道检测机器人、QV潜望镜、毒气检测仪、发电机组、抽水泵等21类专业设备约801台。公司目前具备水利行业安全生产标准化二级单位、市政公用工程总承包三级、质量管理体系ISO9001、环境管理体系ISO140001、职业健康安全管理体系ISO45001、城镇集中式污水处理设施运营服务二级单位、水质检测CMA资质认定等多项资质。
宝安排水公司自成立以来，有效应对了598多场黄色预警及以上暴雨和“妮妲”“天鸽”“帕卡”“山神”“山竹”“苏拉”等16个正面影响宝安的台风，有效扭转了多年来困扰宝安“逢雨必涝”的被动局面。同时，宝安排水公司在水污染治理攻坚战中当先锋、打头阵，成为区委区政府实施治水提质的重要抓手，为宝安打赢水污染治理攻坚战、实现全面“消黑”、精准治污、实现水质V类及达优过半作出了重要贡献。
公司成立以来取得治涝治污的一系列成绩，得到上级单位领导和社会各界的一致肯定，先后荣获2016年深圳市防汛防旱防风工作先进集体、2018年宝安区水污染治理攻坚战先进企业、2019年深圳市水污染治理青年先锋队、2019年宝安区水污染治理攻坚战先进单位、2019年宝安区国资系统先进党支部、2020年宝安区水污染防治攻坚先进企业、2021年深圳市先进基层党组织、2021年度宝安区青年安全生产示范岗、2021年广东最美应急集体、2022年广东省应急救援先进集体、2023年广东省市政行业协会科学技术一等奖、2024年驰援湖南洞庭湖抗洪救灾获应急管理部、湖南省应急委员会感谢信、2024年度广东省市政行业协会先进单位等荣誉。
