北京市环境保护科学研究院（以下简称北京市环科院）是全国第一家从事环境保护的科研机构。她的前身是1957年成立的建工部市政研究所，1973年改名为北京市环境保护科学研究所，1994年正式改为北京市环境保护科学研究院。
北京市环科院现有职工237人，其中，研究员及教授级高级工程师7人、副研究员及高级工程师59人、享受国务院政府津贴16人，获国家级、市级突出贡献专家8人。
作为我国首批有权授予环境工程硕士学位的单位，历年来北京市环科院已培养硕士研究生100余人。
北京市环科院下设：大气污染防治研究所、水环境与水资源保护研究所、环境规划与政策法规标准研究所、固废污染防治研究所、污染场地评价与修复研究所、生态与城市环境研究所、环境分析测试中心、环境模拟与信息中心、环境工程设计所、环境技术咨询所、总工程师办公室。
以北京市环科院为依托单位的工程中心和重点实验室有：国家城市环境污染控制工程技术研究中心（国家科技部）、国家环境保护工业废水污染控制工程技术（北京）中心（国家环境部）、污染场地风险模拟与修复北京市重点实验室（北京市科委）、北京水环境技术与设备研究中心（北京市科委）。
北京市环科院具有国家建设项目环境影响评价甲级资格证书、环境污染治理设施运营（生活污水、工业废水）甲级资质，以及国家发改委颁发的工程咨询甲级资质证书。北京市环科院所属的“北京市环科环境工程设计所”，具有市政行业排水工程专业甲级设计资质、环境工程（水污染防治工程）专项甲级设计资质、固体废物处理处置工程专项乙级设计资质。
经过在环保战线50余年的发展、建设，北京市环科院在技术研究、法规制定、污染控制工程设计、生态工程建设、环境影响评价、区域规划、产品开发等方面均取得了丰硕的成果。其中，获得国家级各种科技奖励近30余项，获省（部）级科技奖励140余项，取得国家重点环境保护实用技术与专利60余项，并且多次在北京市科研院所“改革与发展”考评中获得一、二等奖励。
多年来，北京市环科院完成了大量科研项目，开发出多种实用化技术，同时为改善首都环境质量，承担了大量重大、急需的研究项目，为国家及北京市政府环境决策提供了重要的技术支持与服务。迄今为止，北京市环科院共完成各类环境科学与环境技术方面的研究项目900余项。在全国近30个省（市）自治区（包括香港地区）完成治理工程1500余项，环境影响评价3500余项。
