《方案》提出，探索建立多元化补偿机制，完善生态保护财力支持机制，逐步加大对农产品产区和重点生态功能区转移支付力度，完善生态保护成效与资金分配挂钩的激励约束机制。
《方案》要求，要完善大气重污染天气应急联席会议制度，推进区域联防联控和预警预报。开展大气污染程度、污染物输送规律研究，结合地理空间特征、城市空间分布，健全大气污染防治区域联动制度。完善河长制，建立“水十条”实施情况考评、上下游联合交叉执法等制度。
此外，《方案》还提出，在开展自然资源资产负债表编制试点的地区，同时开展领导干部自然资源资产离任审计试点。建立生态环境损害责任终身追究制。实行各级党委和政府领导成员生态文明建设一岗双责制。
