周集中
人物简介
周集中教授是国际著名的环境微生物学家。多年来致力于研发面向环境科学和工程的宏基因组学技术，在解析微生物对环境变化的响应机制上有许多重要成果，也在环境微生物网络构建、微生物多样性和生态系统功能方向引领了国际学科发展。
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周集中
清华大学环境学院教授
周集中，1959年8月出生于湖南新邵，生物学家，现任美国橡树岭国家实验室环境基因组学研究中心主任，清华大学环境学院教授。
1981年12月毕业于湖南农业大学植物保护专业，后又获得该校昆虫专业硕士学位并留校任教。后在美国华盛顿州立大学获得分子遗传学和细胞生物学博士学位。2001年7月12日在白宫授予其美国总统青年科学家奖。
- 中文名
- 周集中
- 出生日期
- 1959年8月
- 毕业院校
- 湖南农业大学
- 主要成就
- 2000年度的环境科学部的杰出成就奖
- 主要成就
- 1998和2001的橡树岭国家实验室的研究成果奖
承担美国“Genomes to Life”等重大项目20余项 - 代表作品
- 专著《Microbial Functional Genomics》
- 职 称
- 中国清华大学环境学院教授
目录
人物经历
编辑 播报1981年考取湖南农业大学昆虫专业硕士研究生，师从著名的昆虫生态学家陈常铭教授，进行数学生态研究。
1985年获硕士学位，留湖南农业大学任教。
1986年考取中国科学院环境生态研究中心系统生态室博士生，师从于已故的国际上著名的生态学家马世骏教授，从事农业生态系统的研究。
1993年5月周集中在华盛顿州立大学（Washington State University）获得分子遗传学和细胞生物学博士学位。
1993年6月1997年6月在美国密歇根州立大学（Michigan State University）美国自然科学基金会资助的微生物生态中心，跟随美国科学院院士、美国微生物学会主席，国际上享有崇高盛望的微生物生态学家詹姆斯.迪杰（James Tiedje）教授从事博士后工作，主要进行微生物分子生态研究。
1996年周集中博士获得美国能源部杰出博士后资助来到橡树岭国家实验室工作，不久即被聘为研究员。
1997年6月至今在美国橡树岭国家实验室先后任研究员、高级研究员、杰出研究员和环境基因组学研究中心主任。微生物学权威刊物Applied and Environmental Microbiology 杂志主编之一，美国微生物科学院（American Academy of microbiology）院士。2004年1月任中南大学“升华名师”微生物学科责任教授。
2010年9月－今，中国清华大学环境学院教授。
工作履历
编辑 播报1985－1986 中国 湖南农业大学 讲师
1986－1988 中国 中国科学院动物所/生态环境研究中心 助理研究员 (攻读博士学位)
1988 加拿大 加拿大卡尔加里大学（University of Calgary, Calgary, Alberta, Canada）访问学者（Visiting Scientist）
1993－1995 美国 国家自然科学基金会微生物生态研究中心（NSF Center for Microbial Ecology）博士后（Postdoctoral Research Associate）
1996－1997 美国 橡树岭国家实验室（Oak Ridge National Lab）博士后（Alexander Hollaender Distinguished Postdoctoral Fellow）
1997－2000 美国 橡树岭国家实验室环境科学部（Environmental Sciences Division, Oak Ridge National Lab）研究员（Staff Scientist）
2001－2002 美国 橡树岭国家实验室（Oak Ridge National Lab）高级研究员（Senior Staff Scientist）
2000－2004 美国 橡树岭国家实验室（Oak Ridge National Lab）环境基因学科带头人（Science Leader for Environmental Genomics Program）
2003－2005 美国 橡树岭国家实验室（Oak Ridge National Lab）资深研究员（Distinguished R&D Staff Scientist）
2005－今 美国 俄克拉荷马大学植物学与微生物学系环境基因研究所（Institute for Environmental Genomics, Department of Botany and Microbiology, University of Oklahoma University of Oklahoma）首席教授（ Presidential Professor），所长（Director）
2006－今 美国 劳伦斯-伯克利国家实验室（Lawrence Berkeley National Laboratory）兼职高级研究员（Adjunct Senior Scientist）
2010年9月－今，中国清华大学环境学院教授。
研究方向
编辑 播报微生物功能基因组学、基因组学研究技术、微生物生态和极端环境条件下的微生物以及群落和生态系统基因组学等多个领域。
出版图书
编辑 播报工作成果
编辑 播报从1997年，周博士在橡树岭国家实验室获得许多不同的奖励，例如，
2000年度的环境科学部的杰出成就奖，1998和2001的橡树岭国家实验室的研究成果奖。
承担美国“Genomes to Life”等重大项目20余项及中国海外青年合作研究基金等多项课题。
先后获得2001年度美国青年科学家总统奖以及美国能源部和橡树岭国家实验室青年科学家奖等多项奖励，
曾任第七届、九届和十一届国际微生物基因组学大会主席。
主编了微生物功能基因组学领域的第一本专著《Microbial Functional Genomics》。
在Science, Nature Review Microbiology, Nature Climate Change, Nature Communications, PNAS, Ecology Letters, ISME Journal, mBio等重要杂志发表论文540余篇(Citations >20,000, H-index, 75 based on Web of Science; Citations >29,000, H-index, 91 based on Google Scholar)。
担任ISME J, mBio, AEM等著名期刊主编，F1000推荐专家。
成立“周集中—石小娅”奖学金，由周集中及夫人石小娅捐赠，专用于奖励清华大学从事生态学及环境科学与工程的优秀学生，代表了周集中教授对莘莘学子的激励。作为环境学院唯一个人出资成立的奖学金，周集中表示，“捐赠不是因为富有，只是尽自己的微薄之力对社会做些有意义的事。”
奖励与荣誉
编辑 播报1996 Alexander Hollaender杰出博士后奖（Alexander Hollaender Distinguished Postdoctoral Fellow）（此奖项由美国能源部设立，是美国最具声望的博士后奖项）
1998橡树岭国家实验室杰出成果奖（Research Accomplishment Award）
1999 橡树岭国家实验室杰出成就奖（Superior Performance Award）
2001 美国能源部青年科学家奖 (DOE Office of Science’s 2001 Early Career Award for Scientists and Engineers
2001 美国青年科学家总统奖（Presidential Early Career Award for Scientists and Engineers from the President of the United State of America）（美国青年科学家最高荣誉）
2004 CCTV纪念邓小平诞辰100周年专门小组会谈海外中国科学家唯一代表
2006 俄克拉荷马大学首席教授（Presidential Professor）2005 联邦实验室联盟技术转化杰出奖（Federal Laboratory Consortium award for Excellence in Technology Transfer）
2009 环境功能基因芯片（Geochip）研发获全球百大创新技术研发奖（R&D 100 Award，2009年全球最具科学创新和技术突破，并且具有极高商业化前景的100项科技成果，研发杂志评选，有极高的国际影响力）
2009 建国60周年庆典海外特邀代表
2009 俄克拉荷马亚洲协会杰出亚裔美国人（Outstanding Asian American for the Asia Society of Oklahoma）
2015 欧内斯特·奥兰多·劳伦斯奖(Ernest Orlando Lawrence)，劳伦斯奖是美国能源部颁发的最高奖项，他是近五十年以来获奖的少数华裔学者之一。
学术成果
编辑 播报出版著作：
Zhou, J.-Z., D.K. Thompson, Y. Xu, and James M. Tiedje. 2004. Microbial Functional Genomics. 624pp. John Wiley & Sons, Hoboken, New Jersey.
发表文章：
周集中博士发表论文400余篇，总引用次数超过17000次，H-index为70。2008-2014年部分代表性论著如下：
J. Zhou*, S. Kang*, C. Schadt, and C. Garten. 2008. Spatial Scaling of Functional Gene Diversity across Various Microbial Taxa. Proc. Nat. Acad. Sci, 105: 7768-7773
L. Wu, X. Liu, M. Fields, D. Thompson, C. Bagwell, J. Tiedje, T. Hazen, and J. Zhou*. 2008. Microarray-based whole-genome hybridization as a tool fordetermining prokaryotic species relatedness. ISME J. 2, 642–655.
P. Waldron, J. D.VanNostrand, D. Watson, Z. He, L. Wu, P. Jardine, T. Hazen, and J. Zhou*. 2009. GeoChip analysis of subsurface microbial communities impacted by heavy metal and nitrate contamination. Environ. Sci. Technol. 43: 3529-3534
Van Nostrand, J. D, W. Wu, L. Wu, Y. Deng, J. Carley, S. Carroll, Z. He, B. Gu, J. Luo, C. Criddle, P. Jardine, J. Tiedje, T. Hazen, J. Zhou*. 2009. GeoChip-based analysis of functional microbial communities in a bioreduced uranium-contaminated aquifer during reoxidation by oxygen. Environ. Microbiol. 11: 2611-2626.
H. Gao, Z. Yang, S. Barua, S. Reed, M. Romine, K. Nealson, J. Fredrickson,J. M. Tiedje, and J. Zhou*. 2009. Reduction of nitrate in Shewanella oneidensis dependson atypical NAP and NRF systems with NapB as a preferred electron transport proteinfrom CymA to NapA. ISME J. 3: 966-976.
W. Liu, A. Wang, S. Cheng, B. Logan, H. Yu, Y. Deng, J. van Nostrand, L. Wu, Z. He and J. Zhou*. 2010. Geochip-based functional gene analysis of anodophiliccommunities in microbial electrolysis cells under different operational modes. Environ. Sci.Technol. 44: 7729-7735.
Z. He, M. Xu, D. Ye, S. Kang, L. Kellogg, L. Wu, J. Van Nostrand, S. Hobbie, P. Reich, and J. Zhou*. 2010. Metagenomic analysis reveals a marked divergence in thestructure of belowground microbial communities at elevated CO2. Ecol. Lett. 13: 564-575.
W. Liu, A. Wang, S. Cheng, B. Logan, H. Yu, Y. Deng, J. van Nostrand, L. Wu, Z. He and J. Zhou*. 2010. Geochip-based functional gene analysis of anodophiliccommunities in microbial electrolysis cells under different operational modes. Environ. Sci.Technol. 44: 7729-7735.
J. Zhou*, Y. Deng*, F. Luo, Z. He, Q. Tu, and X. Zhi. 2010. Functional Molecular Ecological Networks. mBio 1(4):e00169-10
T. Hazen, J. Zhou, et al., 2010. Deep-sea oil plume enriches Indigenous oil-degrading bacteria. Science 330: 204-208.
J. Zhou*, Y. Deng, F. Luo, Z. He, and Y. Yang. 2011. Phylogenetic MolecularEcological Network of Soil Microbial Communities in Response to Elevated CO2. mBio, 294): doi:10.1128/mBio.00122-11.
J. Zhou*, L. Wu, Y. Deng, X. Zhi, Y. Jiang, Q. Tu, J. Xie, J. D. VanNostrand, Z. He, and Y. Yang. 2011. Reproducibility and Quantitation of Amplicon Sequencing-Based Detection. ISME J. 5:1303-1313.
J.Zhou*, Q. He, C. L. Hemme, A. Mukhopadhyay, K. Hillesland, A. Zhou, Z. He, J.D. Van Nostrand, T. C. Hazen, D. A. Stahl, J. D. Wall, and A. P. Arkin. 2011. How sulfate reducing microorganisms cope with stress: lessons from systems biology. Nature Review in Microbiology 9: 452-466.
Y.Liang, J.Van Nostrand, Y. Deng, Z. He, L. Wu, X. Zhang, G. Li and J. Zhou*. 2011. Functional gene diversity of soil microbial communities from oilcontaminatedfields in China. ISME J. 5: 403-413.
J. Zhou*, L. Wu, Y. Deng, X. Zhi, Y. Jiang, Q. Tu, J. Xie, J. D. Van Nostrand, Z. He, and Y. Yang. 2011. Reproducibility and Quantitation of Amplicon Sequencing-Based Detection. ISME J. 5:1303-1313.
J. Zhou*, K. Xue, J. Xie, Y. Deng, L. Wu, X. Cheng, S. Fei, S. Deng, Z. He, J. van Nostrand, and Y. Luo. 2012. Microbial Mediation of Carbon Cycle Feedbacks to Climate Warming. Nature Climate Change, 2:106-110.
Z. He, Y. Piceno, Y. Deng, M. Xu, Z. Lu, T. DeSantis, G. Andersen, S. E. Hobbie, P. B.Reich, and J. Zhou*. 2012. The phylogenetic composition and structure of soil microbial communities shifts in response to elevated carbon dioxide. ISME J, 6: 259-272.
Z. Lu, Y. Deng, J. D. Van Nostrand, Z. He, J. Voordeckers, A. Zhou, Y.-J. Lee, O.Mason, E. Dubinsky, K. Chavarria, L. Tom, J. Fortney, R. Lamendella, J. K. Jansson, P.D’haeseleer, T. Hazen, and J. Zhou*. 2012. Microbial gene functions enriched in the Deep water Horizon deep-sea oil plume. ISME J., 6: 451-460.
Y. Yang*, Y. Gao, Q. Lin, D. Xu, H. Yu, L. Wu, Y. Hu, X. Li, Z. He, Y. Deng, S. Wang and J. Zhou. 2013. The microbial gene diversity along an elevation gradient of the Tibetan grassland. The ISME journal, 8(2), 430-440.
Y. Yang,*, L. Wu, Q. Lin, M. Yuan, D. Xu, H. Yu, Y. Hu, J.C. Duan, X. Li, Z. He, K. Xue, S. Wang, and J. Zhou.2013. Responses of the functional structure of soil microbial community to livestock grazing in the Tibetan alpine grassland, Global Change Biology, 19: 637–648.
J. Zhou*, Y. Jiang, Y. Deng, Z. Shi, B. Zhou, K. Xue, L. Wu, Z. He, and Y. Yang. 2013. Random Sampling Process Leads to Overestimation of β-Diversity of Microbial Communities. mBio 4: e00324-13 (doi:10.1128/mBio.00324-13)
J. Zhou*, W. Liu, Y. Deng, Y. Jiang, K. Xue, Z. He, J. D. Van Nostrand, L. Wu, Y. Yang, and A. Wang. 2013. Stochastic assembly leads to alternative communities with distinct functions. mBio, 4: e00584-12
Q. Tu, Z. He, Y. Deng, and J. Zhou*. 2013. Strain/Species-Specific Probe Design for Microbial Identification Microarrays. Applied and Environmental Microbiology. Xu, M., Z. He, Y. Deng, L. Wu, J.D. van Nostrand, S. E. Hobbie, P. B. Reich, and J.-.Z. Zhou. 2013. Elevated CO2 influences microbial carbon and nitrogen cycling. BMC microbiology, 13(1), 124.
D. Qiu, H. Wei, Q. Tu, Y. Yang, M. Xie, J. Chen, M. H. Pinkerton, Y. Liang, Z. He, and J. Zhou*. 2013. Combined genomics and experimental analyses of respiratory characteristics of Shewanella putrefaciens W3-18-1. Applied and environmental microbiology.
Y. Lee, J. D. van Nostrand, Q. Tu, Z. Lu, L. Cheng, T. Yuan, Y. Deng, M. Q. Carter, Z. He, L. Wu, F. Yang, J. Xu, and J. Zhou*. 2013. The PathoChip, a functional gene array for assessing pathogenic properties of diverse microbial communities. The ISME J., doi: 10.1038/ismej.2013.88.
Y. Chan, J. D. Van Nostrand3, J. Zhou, S. B. Pointing, and R. L. Farrell. 2013. Functional ecology of an Antarctic Dry Valleys landscape. Proc. Nat. Acad. Sci, 110: 8990-8995. doi: 10.1073/pnas.1300643110.
A. Zhou, E. Baidoo, Z. He, A. Mukhopadhyay, J. K. Baumohl, P. Benke, M. P. Joachimiak, M. Xie, R. Song, A. P. Arkin, T. C. Hazen, J. D Keasling, J. D. Wall, D. A. Stahl, and J. Zhou*. 2013. Characterization of NaCl-tolerance in Desulfovibrio vulagris Hildenborough through experimental evolution. The ISME J. doi: 10.1038/ismej.2013.60.
H. Jiang, Q. He, Z. He, C. L. Hemme, L. Wu, and J. Zhou*.2013. Continuous Cellulosic Bioethanol Fermentation by Cyclic Fed-Batch Co-Cultivation. Appl. Environ. Microbiol. 79: 1580-1589.
X. Li, Y. Deng, Q. Li, C. Lu, J. Wang, H. Zhang, J. Zhu, J. Zhou*, and Zhili He*. 2013. Shifts of functional gene representation in rhizosphere microbial communities under elevated ozone. The ISME J, 7: 660-71.
J. Zhou*, Y. Deng, P. Zhang, K. Xue, Y. Liang, JVD. Nostrand, Y. Yang, Z. He, L. Wu, D.A. Stahl, T. Hazen, J.M. Tiedje and A.P. Arkin (2014) Stochasticity, Succession and Environmental Perturbations in a Fluidic Ecosystem, PNAS, 201324044.
申请专利、注册软件：
美国专利 No. 7,759,057.Method for analyzing microbial communities.Zhou, J.-Z., L. Wu, and X. Liu. 2010.
