1982年毕业于武汉大学水利学院治河专业，1985年和 1989年在清华大学水利工程系水力学及河流海岸动力学专业分别获硕士和博士学位，1989至1991年在北京大学做博士后研究工作。曾在日本北海道大学土木工程系、牛津大学工程力学系作为访问学者进行学术交流和合作研究。1992年起在北京大学任教授。

1996年获国家杰出青年基金资助。

1989年在清华大学获博士学位；

1989－1991年在北京大学城市与环境学系地貌学专业从事博士后研究；

1992年被北京大学聘为教授；

1995年组织创办北京大学环境工程研究所；

1998~1999年在牛津大学做访问学者，2002年组建环境工程系。

1992年获钱宁泥沙科学奖；

1994年获首届中国博士后十佳（国氏奖）、中国青年科技奖；

1995年和1997年获国家教委科技进步奖（甲类）；

1999年获国家教委科技进步奖（乙类）。

要从事两相流基本理论及其在动力地貌学和环境科学与工程中的应用研究。重点研究高含沙固液两相流和风沙运动机理主。在固液两相流方面，从动力理论的颗粒微观运动分析入手，提出了高浓度固液两相流运动的描述方法，找到了高浓度和低浓度两种情形下颗粒速度分布函数之间的关系，理论模型能够同时描述低浓度和高浓度固液两相流运动，克服了传统方法的缺陷。在风沙两相流方面：获得了国内外最系统和全面的一整套风洞实测资料；提出了能同时反映跃移层内、外挟沙气流流速特性的风速廓线确定方法，获得了能充分反映粒径影响的风速分布和输沙率公式，揭示了风洞尺度变化及边壁对风沙运动的影响。提出了流域水土流失快速评估方法、河流系统健康评估方法和基于生态环境保护等多目标和多约束条件的填海工程综合优化方法，在实际中得到了应用。曾经主持国家自然科学基金重大项目、欧盟科技合作项目（INCO-DC）、中国-加拿大合作项目（CIDA）等20余项项目。获部级科技进步二等奖两项以及多项其它科技奖励。发表论文被SCI收录20余篇，EI收录40余篇，出版专著2部。曾获得中国青年科技奖、首届中国博士后十佳等荣誉。

倪晋仁还担任全国政协委员、全国人口资源环境委员会委员、特邀国家土地监察专员、国际水沙科学协会（IASWS）常务理事、国际水力学会《International Journal of River Basin Management》编委、《科学通报》特邀编辑、加拿大Regina大学兼职教授、《应用基础与工程科学学报》编委会主任、中国自然资源学会理事等。已出版专著3部、译著1部，发表学术论文100余篇（SCI收录50余篇，EI收录50余篇），获国家发明专利3项。获2项国家教委科技进步奖二等奖，还曾获首届全国十佳博士后奖、中国青年科技奖、钱宁泥沙科学个人奖等，入选国家“百千万人才工程”。指导50余名研究生获博士、硕士学位。

1、Maosheng Zheng; Yuhao Tian; Tang Liu; Tao Ma; Li Li; Can Li; Muhammad Ahmad; Qian Chen; Jinren Ni*,Minimization of nitrous oxide emission in a pilot-scale oxidation ditch: Generation, spatial variation and microbial interpretation, Bioresource Technology, 179卷, pp 510-517, 2015/1.

2、*Sitong Liu; Zuotao Zhang; Jinren Ni,Behavior detection and activity recovery of damaged anammox bacteria culture after accidental overheating, Chemical Engineering Journal, 259卷, p 70-78, 2015.

3、Yin, Xiaochen; Liu, Wen;*Ni, Jinren,Removal of coexisting Cr(VI) and 4-chlorophenol through reduction and Fenton reaction in a single system, Chemical Engineering Journal, 248卷, pp 89-97, 2014/7/15.

4、Liu, Wen; Sun, Weiling; Han, Yunfei; Ahmad, Muhammad;*Ni, Jinren,Adsorption of Cu(II) and Cd(II) on titanate nanomaterials synthesized via hydrothermal method under different NaOH concentrations: Role of sodium content, Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects, 452卷, pp 138-147, 2014/6/20.

5、Liu, Wen; Zhang, Pan; Borthwick, Alistair G. L.; Chen, Hao;*Ni, Jinren,Adsorption mechanisms of thallium(I) and thallium(III) by titanate nanotubes: Ion-exchange and co-precipitation, Journal of Colloid and Interface Science, 423卷, pp 67-75, 2014/6/1.

6、Zheng, Maosheng; He, Da; Ma, Tao; Chen, Qian; Liu, Sitong; Ahmad, Muhammad; Gui, Mengyao;*Ni, Jinren,Reducing NO and N2O emission during aerobic denitrification by newly isolated Pseudomonas stutzeri PCN-1, Bioresource Technology, 162卷, pp 80-88, 2014/6.

7、Zou, Shiqiang; Yao, Shuo;*Ni, Jinren,High-efficient nitrogen removal by coupling enriched autotrophic-nitrification and aerobic-denitrification consortiums at cold temperature, Bioresource Technology, 161卷, pp 288-296, 2014/6.

8、*Ni, J. R.; Wu, A.; Li, T. H.; Yue, Y.; Borthwick, A. G. L.,Efficient Soil Loss Assessment for Large Basins Using Smart Coded Polygons, JOURNAL OF ENVIRONMENTAL INFORMATICS, 23(2), pp 47-57, 2014/6.

9、Pang, Lina;*Ni, Jinren; Tang, Xiaoyan,Fast characterization of soluble organic intermediates and integrity of microbial cells in the process of alkaline anaerobic fermentation of waste activated sludge, Biochemical Engineering Journal, 86卷, pp 49-56, 2014/5/15.

10、Liu, Wen;*Ni, Jinren; Yin, Xiaochen,Synergy of photocatalysis and adsorption for simultaneous removal of Cr(VI) and Cr(III) with TiO2 and titanate nanotubes, WATER RESEARCH, 53卷, pp 12-25, 2014/4/15.

11、Lei, Li;*Ni, Jinren,Three-dimensional three-phase model for simulation of hydrodynamics, oxygen mass transfer, carbon oxidation, nitrification and denitrification in an oxidation ditch, WATER RESEARCH, 53卷, pp 200-214, 2014/4/15.

12、Liu, Wen; Borthwick, Alistair G. L.; Li, Xuezhao;*Ni, Jinren,High photocatalytic and adsorptive performance of anatase-covered titanate nanotubes prepared by wet chemical reaction, Microporous and Mesoporous Materials, 186卷, pp 168-175, 2014/3/1.

13、Zhu, Yuling; Zhu, Hancan; Qiu, Muqing; Zhu, Tingting;*Ni, Jinren,Investigation on the mechanisms for biotransformation of saponins to diosgenin, World Journal of Microbiology and Biotechnology, 30(1), pp 143-152, 2014/1.

14、段明君;倪晋仁,Pseudomonas sp.QG6降解喹啉过程中除磷特性及影响因素研究, 北京大学学报(自然科学版), 02期, pp 361-368, 2014.

15、Zuotao Zhang; *Sitong Liu,Insight into the overconsumption of ammonium by anammox consortia under anaerobic conditions, Journal of Applied Microbiology, 117(6), p 1830-1838, 2014.

16、Zuotao Zhang; *Sitong Liu,Hot topics and application trends of the anammox biotechnology: a review by bibliometric analysis, Springerplus, 3卷, p 220-225, 2014.

17、马九鹏，*倪晋仁，刘唐,潮间带湿地底栖动物生物多样性特征比较分析, 北京大学学报(自然科学版), 50(6), pp 1077-1086, 2014.

18、Liu, Wen; Sun, Weiling; Borthwick, Alistair G. L.;*Ni, Jinren,Comparison on aggregation and sedimentation of titanium dioxide, titanate nanotubes and titanate nanotubes-TiO2: Influence of pH, ionic strength and natural organic matter, COLLOIDS AND SURFACES A-PHYSICOCHEMICAL AND ENGINEERING ASPECTS, 434卷, pp 319-328, 2013/10/5.

19、Liu, Wen; Chen, Hao; Borthwick, Alistair G. L.; Han, Yunfei;*Ni, Jinren,Mutual promotion mechanism for adsorption of coexisting Cr(III) and Cr(VI) onto titanate nanotubes, Chemical Engineering Journal, 232卷, pp 228-236, 2013/10.

20、倪晋仁; 卢宇飞; 付东康; 吴绍祖; 吴广安; 于亮,处理印染生化出水的絮体回流混凝工艺, 中国, 中华人民共和国国家知识产权局, ZL 201310428849.4.

等385条科研成果请查看科研之友。[1] 

2015年7月31日，入选中国科学院院士增选初步候选人名单。[2] 

2015年12月7日，被增选为中国科学院院士[3]  。