当中国土木工程学会从原挂靠在铁道部转由城乡建设环境保护部接管后，市政工程学术委员会也由建筑学会调整到土木学会。1985年2月由城乡建设环保部城建司向中国土木工程学会提出了成立给水排水学会的申请报告，并上报中国科协。同年9月中国科协批复，同意在土木学会内成立给水排水专业委员会。1985年11月在泰安市召开的市政工程学术委员会年会期间，举行了给水排水专业委员会的成立大会。1987年，更名为中国土木工程学会给水排水学会。1999年改称中国土木工程学会水工业分会。
第一届理事会（1985.11-1990.5）理事长为王业俊先生（中国市政工程华北设计院原总工程师），第二届理事会（1991.5-1996.6）理事长为许保玖先生（清华大学教授），第三届理事（1996.6-2002.5）理事长为聂梅生女士（建设部科技司司长），第四届理事会（2002.5 - 今） 理事长为聂梅生女士。
第一届理事会期间学会挂靠在建设部城建司。1991年上级学会根据《中国土木工程学会分科学会组织条例》，分科学会应挂靠在本专业领域内具有较高科技水平，热心支持学会工作，并能提供人力、物力、财力资助的企事业单位的规定，决定自1991年起挂靠在北京市市政工程设计研究总院。
1985年在泰安成立给水排水专业委员会时，为了健全下属组织机构，便于开展深入学术交流活动，便决定成立专业学组。在给水排水专业委员会改称学会后，学组改为专业委员会。1986年5月排水专业委员会在天津成立，挂靠中国市政工程华北设计院；1986年10月给水专业委员会在上海成立，挂靠上海市政工程设计院；同期机电专业委员会在贵州成立，挂靠中国市政工程东北设计院；1987年3月结构专业委员会在贵阳成立，挂靠北京市市政工程设计研究总院；同期建筑给水排水专业委员会在西安成立，挂靠上海市民用建筑设计院（现在的上海现代建筑集团）；1990年4月工业给水排水委员会在绍兴成立，挂靠在北京化学工业研究院，1994年起挂靠化工部第三设计院。
为了专题研讨的需要，在专业委员会下还先后设立了不作为常设机构的专题研讨会30余个。
水工业分会是以设计院、大专院校、科研院所为主体，广泛联系水务管理、自来水公司和污水处理厂等水工业企业的工程技术人员组成的学科学术组织。其宗旨是开展学术交流，推动行业科技进步，促进水工业科学技术发展与繁荣。
自1978年开始学术活动至今已32年，自1985年成立独立的给水排水学术组织以来也已25年了，一句话自改革开放以来，在建设部领导下，在中国土木工程学会带领、指导下，始终围绕以完成“六五”至“十一五”各历史阶段的给水排水工程建设和环境治理为目标，以分会为平台，组织开展了大量的不同层次的国内外学术与技术交流研讨活动，为促进我国水工业领域的科技进步与创新，进行了卓有成效的工作。其成果主要表现在：一是取得了大量的学术专著、科研与科技交流成果，以及关于中国水工业的系列论著；二是这些成果直接促进了给水排水工程设计从科技信息、设计技术、设计手段和装备落后的状态中迅速摆脱出来，以适应国家经济建设快速发展的要求，完成了一批又一批的给排水现代化工程设计，把科学技术转化为生产力，有的工程已达到了国际先进水平；三是促进了我国自己的各专业配套齐全的完整的给水排水工程设计规范标准体系的建立和完善；四是促进了大专院校和科研院所的教育事业的进步与研究开发，为工程设计、建设、管理提供了宝贵的智力与科技支持；五是直接促进和带动了我国水工业制造业从无到有、到发展和繁荣；六是引领和促进了教育、研究、设计、建设、管理、运营、制造业企业，或者按照水工业体系的组成部分说，水工业企业、水工业制造业和水工业高新技术产业之间的合作共赢的产业链的建立和密切联系。同时作为对外窗口之一，也与国外同业组织建立了密切的交往和联系。
回顾分会的历史沿革，我们不能忘记我国给水排水学科的奠基者、开拓者顾康乐、陶葆揩、过祖源先生，不能忘记我们学会的倡建者并为学会发展做出杰出贡献的王业俊、吴正淮、钟淳昌、钱崇湛等老总和杨钦先生等已经谢世的前辈，他们的大师风范长留我们心中！不能忘记至今仍然健在但年事已高的以许葆玖名誉理事长为首的，曾经担任过学会领导或名誉理事为学会工作和行业发展做出过重大贡献的，至今仍然关心学会发展的李远义、许京骐、宋仁元、沈大年等德高望重的老学者、老专家，让我们敬祝他们健康长寿！不能忘记历届建设部的领导与城建司、科技司、人事司等有关部门所给与的的领导、支持和监管，不能忘记中国土木工程学会历届领导和秘书处的指导与支持，以及兄弟学会、协会给与的帮助与协作。我们的给水排水事业、我们的学会就是这样在新老交替、继往开来中，在不断地传承、改革、创新和协作中发展壮大的。
在住房与城乡建设部部领导的直接关怀下，在中国土木工程学会谭庆琏理事长、张雁秘书长的直接指导与帮助下，在中国城镇供水排水协会李振东会长、邵益生秘书长的大力支持下，通过清华大学的专家学者的积极建议和全体理事的共同努力下，水工业分会第五次理事会顺利召开，我们应该向关心、指导和支持分会的各位领导、部门和为行业发展不遗余力做出奉献的新老理事们表示衷心的感谢和崇高的敬意！水工业分会第五届理事会在成立25年的新起点上，一定会更加朝气蓬勃、生机焕发，取得新的更大的成就。
