目前,学院共有教职工81人,其中专任教师63人,包括教授21人,博导20人,副教授19人,形成了结构优化、团结协作、创新进取的师资队伍。学院已形成多个在国内外具有较高学术影响的研究方向。建院以来,学院承担了包括水专项、973、863课题、国防预研、国家自然科学基金重点项目、面上项目等国家及省部级以上科研项目131项。先后获中国石油和化学联合会科技进步一等奖、江苏省科技进步二等奖、环保部环境保护科学技术二等奖等奖项;SCI论文300余篇,授权发明专利70余件;完成环境污染治理及生物化工领域的科研成果转化80余项。
南京理工大学环境与生物工程学院已成为我国环境、生物工程领域科学研究和高层次人才培养的重要基地。